A sztárpár válásának kezdeményezője a mindig engedelmes és csendes Katie Holmes volt. Öt év házasság után a színésznő, férje tudta nélkül, kérelmet nyújtott be az egyik New York-i bíróságon. A hivatalos ok a "kibékíthetetlen különbségek". Katie ugyanebben a nyilatkozatában arra kérte a bíróságot, hogy a volt férjétől kapott jogi támogatást és a gyerektartás folyósítását folyósítsa. A pár később megállapodást írt alá a válás feltételeiről.
A lánya nevelését Katie Holmes és Tom Cruise válásának egyik fő okának nevezik. A színésznő nem volt elégedett azzal, hogy közös 6 éves Suri életében az összes fontos döntést Tom hozta meg. Egy szerető 49 éves apa mindenben engedelmeskedett a gyermek szeszélyeinek és vágyainak, miközben megfeledkezett feleségével a nevelés módszereiről.
Cathynek nem tetszett, hogy a babát szándékosan ismertették meg a Szcientológiával, egy vallási doktrínával, amelynek Tom lelkes híve lett. Sőt, a bulvársajtók még azt is feltárták, hogy Cruz Ron Hubbard tanításában majdnem a legmagasabb szintet érte el. Így vagy úgy, Katie soha nem támogatta férjét a hobbijában, az esküvő előestéjén pedig kizárólag a férje iránti szeretet kedvéért adta fel a katolicizmust.
Tom Cruise vallási nézeteinek a lányra gyakorolt negatív következményei miatt Holmes arra törekedett, hogy teljes lányt egyedül és egyedül felügyelhessenek. Nevelésével is egyedül kíván foglalkozni. Ezért beadta a válópert New Yorkban - ebben az államban a bíróságok többnyire az egyik szülő mellett döntenek.
Egy idő után azonban a sztárpár elérte a kölcsönösen kielégítő feltételek aláírását. A lány az édesanyjával marad, New Yorkban él, katolikus iskolába jár, és az apának joga lesz találkozni a gyermekkel. Tom köteles a lánya számára is jelentős költségeket fedezni, a gyerektartást fizetni (az összeget nem közölték, de például a lány teljes ruhatárát már 3 millió dollárra becsülik).
Ismertté vált, hogy Katie Holmes a közeljövőben lánya nevét Scout Holmesra kívánja változtatni. Kijelentette, hogy soha nem tetszett neki a Suri név, és lányát Scoutnak hívja, kedvenc könyvének hősnőjének, A gúnymadár megölésének a nevét. Cruz vezetéknevet azonban a gyermekre bízza, de csak annak jelzésére, hogy ő az apja.
A házasság felbontásának a többi feltételét egyértelműen meghatározták a házassági szerződésben, ezért a bíróságon keresztül nem lesz vagyonmegosztás. Tehát egy házasság előtt önként aláírt jogi dokumentum szerint Katie Holmes-nak 3 millió dollárt kell kapnia a házasság minden egyes évéért és egy kaliforniai kastélyért, amelynek értéke 35 millió dollár (ha a pár több mint 11 évig tartott volna házasságban, Katie követelje az ingatlan felét). Ugyanakkor a házastársak jelenlegi vagyonát 275 millió dollárra becsülik. Egyébként a Szcientológia kánonjai szerint tartott esküvőn Tom hagyományos esküt tett, válás esetén azt ígérte, hogy Katie-nak csak "serpenyő, fésű és macska".
